《科学知识》：迄今为止样本规模最大的癌症全基因组测序研究成果发布！

有利于实验中所，研究成果人员将三个在线库中所所有并不一定癌细胞抽样（共计18640个）的WGS在线展开统合与聚类在线分析，希望计算单单来单单一个大参见标有（Reference signature）（参见标有允许完全并不相同肾脏和在线库除此以外在线的较为，因为完全并不相同肾脏中所确实发生同样的生物学每一次并激发并不相同的等位基因标有）。

首先，研究成果人员将癌细胞中所更整体相似的来展开协同概念为鲜明来展开（Distinct Patterns），这些鲜明来展开又被分为了三类：

（1）在完全并不相同肾脏完全并不相同在线库的癌细胞抽样中所都能被观察到的来展开，被称为重复来展开。

（2）其他各种标志复合组成的来展开，被称为复合来展开 （这种来展开并非抽样中所确实单单现的来展开，而是通过各种类型模拟单单的来展开）。

（3）仅在单个抽样中所萃取到的来展开，被称为单例来展开。

通过对各种来展开展开质量遏制（quality control, QC）分类法，该次萃取共获取82个更非常适合 （即下左图中所的QC green SBS signatures）的SBS和27个DBS参见标有。

左图3 参见标有的比对流程

不久，通过与癌细胞体细胞等位基因（COSMIC）在线库中所的在线合果（即年末研究成果中所已被解剖的等位基因标有）展开比对，注意到本次解剖单单的等位基因标有中所有42个SBS和9个DBS是年末已被解剖过的（如下左图中所橙色条），也就是说， 本次在线分析合果中所新注意到了年末未被解剖的40个SBS和18个DBS等位基因标有（如下左图中所浅橙色条）。

左图4 比对获取的参见标有（浅橙色条为本研究成果中所新注意到的，橙色条为年末被报导的）

不久，研究成果人员还基于上述工作流程（即两轮萃取等位基因标有的方法）合作开发了原是FitMS的插值即配套的软件机器，该款机器可以对病患者癌细胞抽样的WGS合果展开等位基因标有萃取。下左图为研究成果人员适用FitMS对前列腺癌、中所枢神经系统癌细胞和合肺癌三种癌细胞并不一定的抽样展开在线分析的合果，再度可以得单单以下合论：

（1） 每个病患者都确实有完全并不相同数量的（以外或全部）常见标有。在少数情况下，病童也就会运载一种引人注目标有。

（2） 一些常见标有广泛长期存在于完全所有癌细胞并不一定中所（如下左图中所浅黄色点同时长期存在于三种癌细胞并不一定中所），而其他常见标有则只特异长期存在于某种癌细胞中所 （如深绿、浅绿色点只长期存在于前列腺癌中所）。

（3）同样地， 引人注目标有确实是鲜明的（浅橙色点只长期存在于前列腺癌中所）， 也确实发生在多种癌细胞并不一定中所（黑色点既长期存在于前列腺癌又长期存在于中所枢神经系统癌细胞中所）。

左图5 三种癌细胞并不一定常见标有和引人注目标有地理分布及FitMS工作流程

总得来说，这项研究成果通过对大规模在线抽样的挖掘以及多个在线库除此以外的资讯的比对在线分析断定了多种年末未被报导的等位基因标有并不一定。而对常见标有和引人注目标有的概念，也使研究成果人员断定了癌细胞肾脏依赖性等位基因标有地理分布的普遍系统性性。

同时，附加插值（FitMS）的合作开发也为癌细胞诊治给予了简约的机器。相信未来对等位基因标有的资讯，众所周知是对环境或内源性因素与等位基因标有形成除此以外连续性的阐释只能为广大癌细胞病患者给予更加个性化的疗程方案。

注释：

1. Kumar S, Warrell J, Li S, et al. Passenger Mutations in More Than 2,500 Cancer Genomes: Overall Molecular Functional Impact and Consequences. Cell. 2020;180(5):915-927.e16. doi:10.1016/j.cell.2020.01.032

2. Andrea Degasperi et al. Substitution mutational signatures in whole-genome-sequenced cancers of the UK national health service. Science, 2022, doi:10.1126/science.abl9283.